Le nettoyage du laboratoire est un acte régulier, simplifié par l'habitude de ranger ce que l'on utilise juste après s'en être servi, et qui utilise de manière systématique l'eau de Javel :

• Après toute manipulation contaminante : (recherche de BK, diagnostic d'une méningite ...) Nettoyage de la paillasse à la Javel, rinçage à l'eau du matériel puis décontamination du matériel réutilisable.
• Après toute manipulation pendant laquelle on a renversé un produit potentiellement contaminé.
• Avant le repas de midi : nettoyage de la paillasse.
• Le soir : nettoyage de la paillasse, nettoyage du sol à la Javel, nettoyage de la table des prélèvements à la Javel, nettoyage du microscope (se reporter au chapitre sur l'entretien du microscope). Éventuellement, évacuation puis incinération des déchets.

Ce nettoyage qui peut paraître fastidieux au technicien est en fait le garant de sa sécurité. S'il n'est pas effectué, il en sera le premier affecté.